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■035    ▼a(MiAaPQ)Purdue21679754
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a612
■1001  ▼aFreitas,  Pedro  H.F.
■24510▼aImproving  Livestock  Climatic  Adaptation  Through  Genomics▼h[electronic  resource]
■260    ▼a[S.l.]▼bPurdue  University.  ▼c2022
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2022
■300    ▼a1  online  resource(234  p.)
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  85-01,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Brito,  Luiz  F.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--Purdue  University,  2022.
■506    ▼aThis  item  must  not  be  sold  to  any  third  party  vendors.
■520    ▼aAs  the  effects  of  climate  change  become  more  evident,  the  development  of  effective  strategies  for  improving  livestock  climatic  adaptation  and  the  long-term  sustainability  of  animal  food  production  have  become  key  priorities  around  the  world,  including  in  the  US.  Together  with  nutrition,  infrastructure,  and  management  practices,  genetically  improving  animals  is  an  effective  and  lasting  alternative  to  simultaneously  improve  productive  efficiency  and  climatic  adaptation  of  animals.  Genetic  improvement  requires  basic  understanding  of  the  genomic  architecture  of  the  indicator  traits  of  interest  and  the  availability  of  large-scale  datasets.  Understanding  the  role  of  evolution  and  selection  (both  natural  and  artificial)  on  shaping  animal  genomes  is  of  paramount  importance  for  the  optimization  of  breeding  programs  and  conservation  of  genetic  resources.  In  addition,  properly  quantifying  environmental  stress  and  individual  animal  responses  to  thermal  stress  are  still  important  challenges  in  breeding  programs.  Thus,  the  identification  of  optimal  statistical  methods  and  traits  that  better  capture  key  biological  mechanisms  involved  in  the  heat  stress  response  has  the  potential  to  enable  more  accurate  selection  for  thermal  tolerant  individuals.  Therefore,  this  thesis  aimed  to  investigate  complementary  topics  related  to  thermal  tolerance  in  livestock  species  based  on  genomic  information.  A  total  of  946  genotypes  from  34  cattle  breeds,  as  well  as  Datong  yak  (Bos  grunniens)  and  Bali  (Bos  javanicus)  populations,  adapted  to  divergent  climatic  conditions,  were  used  to  investigate  the  genetic  diversity  and  unravel  genomic  regions  potentially  under  selection  for  thermal  tolerance,  with  a  focus  on  Chinese  local  cattle  breeds  and  yak.  Different  signature  of  selection  analyses  and  a  comprehensive  description  of  genetic  diversity  in  32  worldwide  cattle  and  Datong  yak  populations  was  presented.  Moderate  genetic  diversity  was  observed  within  each  Chinese  cattle  population.  However,  these  results  highlighted  the  need  to  adopt  strategies  to  avoid  further  reduction  in  the  genetic  diversity  of  these  populations.  Several  candidate  genes  were  identified  as  potentially  under  selection  for  thermal  tolerance,  and  important  biological  pathways,  molecular  functions,  and  cellular  components  were  identified,  which  contribute  to  our  understanding  of  the  genetic  background  of  thermal  tolerance  in  Bosspecies.  Secondly,  8,992  genotyped  individuals  were  used  to  provide  a  comprehensive  description  of  genotype-by-environment  interaction  effects,  defining  optimal  environmental  variables  based  on  public  weather  station  data,  and  critical  periods  to  evaluate  heat  tolerance  for  various  reproduction,  growth,  and  body  composition  traits  in  US  Large  White  pigs.  The  period  of  30  days  before  the  measurement  date  was  suggested  to  analyze  genotype-by-environment  interaction  for  off-test  weight,  muscle  depth,  and  backfat  thickness.  While  for  number  of  piglets  weaned  and  weaning  weight,  the  suggested  period  ranged  from  the  last  trimester  of  gestation  until  weaning.  This  same  population  was  used  to  access  the  genomic  predictive  ability  of  heat  tolerance  based  on  routinelymeasured  traits  and  explore  candidate  regions  involved  in  the  biological  mechanisms  that  underlie  heat  stress  response  in  pigs.  Genotype-by-environment  interaction  was  identified  for  most  of  the  traits  evaluated,  and  moderate  (0.36  ±  0.05)  breeding  values  prediction  accuracy  were  achieved  using  genomic  information.  Lastly,  various  behavioral,  anatomical,  and  physiological  indicators  of  heat  stress  were  measured  in  a  population  of  1,645  multiparous  Large  White  x  Landrace  lactating  sows.
■590    ▼aSchool  code:  0183.
■650  4▼aPhysiology.
■650  4▼aHumidity.
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■71020▼aPurdue  University.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g85-01B.
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■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2022
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T16932864▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.
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